郭圣通被废的原因主要有以下几点：
政治联姻的破裂：
郭圣通与刘秀的婚姻起初是一场政治联姻。随着刘秀皇权的巩固，他不再需要依赖郭家的支持，这使得他们之间的政治联姻失去了原有的意义。
皇后失德的传言：
尽管历史记载中并没有明确提到郭圣通有何失德行为，但在当时的宫廷政治中，皇后失德往往成为废后的借口。刘秀在巩固皇权的过程中，可能通过散布失德的传言来达到目的。
皇权中心思想的强化：
刘秀在建立东汉时，强调了皇权中心的思想。他认为皇帝应该是国家的最高统治者，后宫作为皇帝的附属机构，应该服从皇帝的意志。在这种情况下，如果郭圣通作为皇后拥有过高的地位或权力，可能会对刘秀的皇权造成威胁。
个人感情因素：
在古代帝王之家，皇帝往往会有多位妃子，这导致皇帝与皇后之间的感情可能会出现裂痕。刘秀与郭圣通之间的感情裂痕可能也是导致其被废的原因之一。
刘秀对阴丽华的愧疚：
刘秀对原配妻子阴丽华有深厚的感情，而阴丽华拒绝成为皇后，刘秀对她心怀愧疚。这种愧疚感可能促使刘秀选择废掉郭圣通，以安慰阴丽华。
天象的契机：
刘秀为了国库的扩充加重赋税和加强奴役，引起众多王公贵族的不满，导致暴乱频起。此时天象出现日食，古人将其解读为大凶的预兆。刘秀趁机废除了郭圣通的皇后之位，宣告了这段政治联姻的终结。
综合以上几点，郭圣通被废的原因是多方面的，包括政治利益、个人感情、宫廷斗争以及天象等。尽管有些原因可能只是表面之词，但不可否认的是，这些因素共同作用，最终导致了郭圣通的皇后之位被废。