慈禧立溥仪为皇帝的原因是多方面的，主要包括以下几点：
维护清朝皇室的统治地位：
慈禧太后面临内忧外患，认为只有通过巩固皇权和增强皇室威信，才能稳定朝局并保住清朝的江山社稷。溥仪作为当时唯一可以代表清朝皇权的合法皇帝，是符合这一要求的人选。
控制年幼的皇帝：
溥仪当时年仅三岁，无法独立处理政务。慈禧太后可以通过掌握“摄政王”和“养母”的职位，实际上在幕后操纵整个朝政，将自己的意志强行施加到政治决策中去。
防止光绪皇帝翻供：
慈禧太后担心自己死后，新皇帝会为光绪皇帝翻供，由于小皇帝年幼，就难免会被保皇党人利用，并把罪恶的矛头指向自己。立溥仪为皇帝可以防止这种情况发生，因为溥仪的生母是慈禧太后的养女瓜尔佳·幼兰，他的外公就是慈禧最信任的荣禄。
利用家族背景：
溥仪的父亲载沣是慈禧太后的干女儿的女婿，这一层关系使得慈禧太后能够更好地控制载沣和溥仪。此外，溥仪的祖父奕譞和父亲载沣在朝中都有着重要的影响力，这为溥仪的继位铺平了道路。
延续自己的权力：
慈禧太后希望通过立溥仪为皇帝，再由隆裕皇后执掌后宫，确保自己的尸身不受亵渎。隆裕皇后本身也是慈禧的侄女，对其忠心耿耿，寄望于这一皇后政权能延续自己遗志。
平衡国内矛盾：
当时清王朝处在风雨飘摇的时代，内忧外患，国内的革命党一天天强大。慈禧身边急迫需要一个既能与外国势力周旋，又能借外国势力来平衡国内矛盾的人，很快她就把目光锁定在载沣身上。
综上所述，慈禧立溥仪为皇帝的决定，既是因为现实政治需要，也是出于自身的利益考虑，具有复杂的历史背景和政治内涵。