三菱系统法兰盘打孔的编程步骤如下：
定义加工坐标系
根据加工对象的坐标系，定义机床的加工坐标系，确定加工坐标系原点和各轴正方向。
确定加工路径
根据钻孔要求，确定钻孔的加工路径，包括孔径、孔深、孔距等。
编写程序
使用G代码编程控制钻孔的深度、速度、进给等参数。
示例程序：
```plaintext
G81 X坐标 Y坐标 Z-10 R2 F100
...（xy坐标直到钻完你要钻的孔）
G80 结束
```
如果在圆上钻法兰孔，使用以下程序：
```plaintext
G34 M6 T01 G90 G54 G0 X0 Y0
G43 H01 G0 Z100
M03 S500 Z10
M08
G81 Z-10 R2 L0 F100
G34 I 为孔距半径 J为第一个孔的角度 K是孔数
G80 结束
G0 Z200
M05
M09
M30
```
检查程序
编写完程序后，需要对程序进行检查，确保程序的正确性和安全性。
加工调试
将编写好的程序上传至数控机床，进行加工调试，检查加工效果和加工精度，优化加工参数。
完成加工
调试完成后，进行正式加工，注意安全操作，确保加工质量和效率。
建议
在编写程序时，确保所有坐标和参数设置正确无误。
在进行加工前，进行充分的模拟和调试，以减少实际操作中的错误。
定期检查和维护数控机床，确保其处于良好的工作状态。