善玉菌是 日语中益生菌的意思，有时特指人体肠道中存在的对人体有益的菌群，主要包括比菲德氏菌（双歧杆菌）等。这些菌群对人体健康具有重要作用，如调节肠道菌群平衡、促进消化和吸收、增强免疫力等。善玉菌可以通过植物或动物乳制品发酵得到，但相对来说更难提取和培养，并且不耐高温、不耐酸，难以保存和有效补充。
在宠物领域，善玉菌也常被用于改善宠物的肠道环境，例如在龟粮中添加善玉菌可以有效地改善龟的肠道健康。此外，善玉菌还被应用于一些保健品中，以帮助调节人体肠道菌群，预防肠道疾病。
需要注意的是，善玉菌并不是一种单一的菌种，而是一类益生菌的总称。因此，在具体应用中，善玉菌的具体成分和功效可能因产品而异。