《申报》停刊的原因主要有以下几点：
政治原因
拒绝政府津贴：《申报》坚持自力更生，拒绝接受政府津贴，因而被勒令停刊。
被国民党CC系控制：抗战后，《申报》被国民党CC系接管，并逐步被国民党官方化，最终因政治立场被迫停刊。
解放军接管：1949年，解放军接管上海，由于《申报》已为中国国民党官方报纸，最终被迫停刊。
经济原因
缺少办刊经费：期刊的主办单位若缺乏经费支持，将无法继续创办，从而导致停刊。
管理原因
违规经营：期刊若违反相关规定，如擅自出版增刊或与正刊宗旨、开本和发行范围不一致，可能会被新闻出版管理机构责令停刊。
缺乏稿件来源：学术期刊若不重视学术价值，审稿不严格，导致稿源缺乏，最终可能停刊。
综上所述，《申报》的停刊是多种因素共同作用的结果，包括政治压力、经济困难和内部管理问题。