皇帝的妹妹在古代中国通常被称为 公主。公主是皇族直系成员，皇帝的妹妹、女儿、姑姑、孙女等都可以称为公主。公主一般都有封号、封地，并且其封号通常有三种形式：以群县为名、以国为名、以美名称。例如，唐朝的太平公主就是以美名称的公主之一。
此外，在特定朝代和情况下，皇帝的妹妹也可能被称为长公主。例如，汉朝时，皇帝的姐妹被称为长公主，地位等同于诸侯王。
因此，综合来看，皇帝的妹妹主要被称为公主，而在某些特定情况下，也可能被称为长公主。