更换林肯MKX的方向机后，编程的步骤如下：
使用专用诊断工具
可以通过车辆制造商的专用诊断工具或者第三方的编程设备来完成编程。这些工具可以帮助您校准转向角度、传感器校准等。
路试匹配
如果是简单的断电后的匹配，通常只需将车辆启动，方向盘左右打到头，方向盘上的黄色灯就会熄灭。但如果更换了方向机，则需要进行更复杂的路试匹配。这通常需要专业人员进行操作，非专业人员无法完成。
使用专用电脑
更换方向机后，可能需要使用专用电脑进行匹配。这包括连接电脑和车辆的诊断接口，然后按照软件提示进行操作。
校准传感器
方向机传感器用于检测方向盘转动角度和转向力。更换传感器后，需要进行校准以确保其与车辆其他系统正确通信。
测试与验证
完成编程后，进行实际驾驶测试，验证方向机的工作情况，确保转向系统正常，无故障。
建议：
由于编程和匹配过程可能较为复杂，建议由专业人员进行操作，以确保安全和效果。
如果您不熟悉这些过程，建议联系林肯授权的维修中心或专业维修人员进行更换和编程。