深化审计软件应用可以从以下几个方面进行：
组织保障
成立专门的审计信息化工作小组或组织机构，明确每个成员的管理范围及工作职责，为审计软件的应用提供有力的组织保障。
制度建设
制定完善的制度体系，使审计软件的应用有章可循，实现管理的规范化和有序化。
过程控制
在系统深化应用过程中，加强管理控制与业务督导，确保流程的标准化与过程的精益化。
管理考核
通过各种考核手段加强审计信息系统的深化应用，进一步促进管理水平的提升。
智慧审计应用
利用“现场审计作业云”“审计业务管理系统”进行人员和项目进度管理，实现审计项目资料集中统一管理，推进项目立项、审前准备、审计实施、审计报告、审计整改、审计归档全链条数字化，实现审计资料电子化，审计进度可视化，全面推进项目管理系统与现场审计系统交互使用。
审计人员培训
加强内部审计人员计算机操作技能的培训，包括Word、Excel、网络及常用电算化软件的基本操作，并着重于解决如何将其在审计工作中加以运用。在此基础上，进行较高层次的培训，实现计算机知识与审计知识的融合。
信息化基础设施建设
企业需要在内部审计信息化方面加大投入和支持，提升内部审计信息化水平，加快内部审计信息化基础设施建设，加强数据安全和保护，有序推进内部审计数字化、智能化和自动化发展，高效实现内部审计信息化应用。
风险识别与风控管理
内部审计部门应把握信息化发展趋势，不断优化审计方法和技术手段，提高数据采集、分析和处理的能力，加强对风险识别和风控管理的能力，从而提高审计的效率和质量。
通过以上策略的实施，可以有效深化审计软件的应用，提升审计工作的效率和质量，增强审计工作的实效性和穿透力。