汉武帝杀窦婴的原因是多方面的，主要包括以下几点：
外戚势力的威胁：
窦婴作为窦太后的侄子，在汉朝末期的权力结构中占据了重要位置。他的存在对汉武帝的统治构成了潜在的威胁。汉武帝通过消除窦婴这一外戚势力，可以削弱窦太后及其家族的影响力，从而加强皇权。
中央集权的需要：
汉武帝在即位后，为了加强中央集权，对朝中的豪强势力进行了严厉的打击。窦婴作为地方豪族的代表，他的影响力在一定程度上阻碍了汉武帝的政策实施。因此，消除窦婴有助于汉武帝更好地推行中央集权政策。
政治斗争的牺牲品：
窦婴与当朝丞相田蚡之间的冲突，以及窦婴为庇护灌夫而与田蚡的激烈对立，成为汉武帝铲除窦婴的导火索。此外，窦婴在朝野中的声望和影响力，使得他成为了汉武帝巩固权力、打击异己的靶子。
遗诏事件：
窦婴在庇护灌夫的过程中，拿出了汉景帝的遗诏，但遗诏没有存档副本，这成为了他的一大罪状。汉武帝以此为由，判处窦婴斩首。
个人恩怨与权力斗争：
汉武帝与窦太后之间的明争暗斗，以及窦婴在这一过程中的角色，使得他成为了汉武帝个人恩怨和权力斗争的一个牺牲品。
综上所述，汉武帝杀窦婴的原因是多方面的，包括消除外戚势力的威胁、加强中央集权、政治斗争的牺牲品、遗诏事件以及个人恩怨与权力斗争等。这些因素共同作用，最终导致了窦婴的悲惨结局。