《寒武纪》的结局中， 捡子独自承担罪责，李永基真面目暴露，最终两人并没有走到一起。具体情节如下：
捡子承担罪责：
捡子的亲生父亲詹士礼和师父都去世了，他不得不以一己之力承担秋门所有的罪责。在前往关押处的路上，捡子乘坐的押解车失控，冲向了河里，但他并没有死，只是借此逃脱。
李永基被关进监狱：
李永基的真面目最终暴露，他被关进了监狱，承担自己的过错。
唐印和捡子的感情：
唐印和捡子之间有着深厚的感情，但在结局中，捡子被带走，唐印虽然一路尾随，但最终并没有和捡子在一起。捡子在被押解车带走前，要求和唐印道别，唐印告诉他不论多久自己都会等他，并深深地吻了他，然后哭着转身离开。
综上所述，《寒武纪》的结局充满了悲伤和遗憾，男女主角并没有走到一起。