《霸王别姬》被禁的原因主要包括以下几点：
同性恋情节：
电影中存在若有似无的同性恋情节，这在当时的思想保守的观众中难以接受。影片中程蝶衣对段小楼产生的爱慕之情，被一些人视为难以接受的“恋爱”。
苦情悲怆的名伶所遭受的屈辱：
影片中对于名伶所遭受的屈辱和苦难的讲述过于赤裸，可能触动了某些敏感的神经。
审查标准：
当时的文化娱乐审查并不是法治行为，审查标准和手续往往根据领导意志实施。有些片子在过审时可能因为领导不注意或心情不错而通过，但公映后可能因为舆论反应或领导不满而被禁。
社会和政治环境：
影片在拍摄和上映的1990年代，中国正处于社会和政治的动荡时期，一些影片可能因为被认为涉及敏感题材而遭到禁映。
尽管《霸王别姬》在初期遭到了禁映，但它在戛纳电影节上获得了金棕榈大奖，并且张国荣还荣获了国际最佳男主角，这些国际认可最终帮助影片在国内重见天日，并取得了巨大的成功。