连长转业后的级别主要是 科员级别。具体来说：
一般情况 ：连长转业后通常被安排为科员一类的非领导职务。
职务对应
副连职对应二级科员。
正连职对应一级科员。
特殊情况
如果连长担任的是副营级职务，转业后可能套用副科级。
在某些情况下，连长转业后可能根据地方单位的具体情况担任更高级别的职务，如副处级或正处级，但这取决于具体地区和单位的安排。
综合以上信息，连长转业后的级别主要是科员级别，具体职务安排可能会因个人情况和地方政策有所不同。建议连长转业前咨询当地的相关部门，了解具体的安置政策和职务安排。