科长在中国公务员体系中属于 乡科级正职干部，通常简称为科级干部。科长在行政级别中处于中层管理岗位，负责管理和指导科室内的各项工作，包括人员调配、任务分配、工作监督以及与其它部门的沟通协调等。科长的级别大致在九至十二级之间，具体级别会根据不同单位性质和职务设置有所差异。
在行政机关中，科长既是职位也是职级，是行政序列中处于最低级别的职级。在县级政府部门中，科长不是职位，而是职级，相当于某某局局长，其职级为正科级；在地（市）级政府部门中，科长是中层干部，即是职位也是职级（有些地市级政府部门为提升档次，将科长称为处长，但其实质还是正科级）；在省（市）级政府部门中，不设科长，最小的就是副处长（副处级）。
在企事业单位中，科长是职位，不是职级，相当于该单位的中层干部。
综合来看，科长在公务员体系中一般对应的是9-13级的中层干部，具体级别会根据所在单位的性质和职务设置有所差异。