宝马3系发动机编程的步骤如下：
购买和安装必要的设备
购买宝马诊断设备，如宝马官方的诊断接口设备（如ICOM）。
安装宝马编程软件，如BMW ISTA（Integrated Service Technical Application）。
连接车辆
将宝马诊断设备连接到车辆的OBD接口或其他相应接口上。
将计算机与诊断设备连接，确保设备与软件通信正常。
软件配置
安装并配置BMW ISTA软件，选择正确的车型和车辆配置文件。
诊断和编程
使用ISTA软件进行诊断和编程操作，包括读取故障码、擦除故障码、重置服务指示灯、参数编程等。
根据需求选择相应的功能，并按照软件提示进行操作。
测试和验证
完成编程后，进行测试以验证编程效果，确保车辆性能、驾驶感受和功能设置符合预期。
建议在专业技师的指导下进行编程操作，以确保安全和效果。