在UG软件中进行钻孔编程并设置G99指令，通常涉及以下步骤：
打开或创建零件模型
启动UG软件并打开需要编程的零件模型，或者创建一个新的零件模型。
进入加工模块
在UG主界面选择“加工”模块，进入加工编程环境。
设置加工环境
设置加工参数，包括切削速度、进给速度等。
选择钻孔类型并设置参数
在加工模块中选择“钻孔”类型，并设置相关的钻孔参数，如孔的位置、深度、直径等。
指定孔位
通过选择孔的几何体（如面、点等）来指定孔的位置。
定义几何体和夹具
定义工件几何体和夹具，以便UG能够准确地生成刀具路径。
生成并预览刀具路径
使用UG的自动编程功能生成刀具路径，并预览以确保路径正确。
后处理为NC代码
将生成的刀具路径后处理为数控机床可以理解的G代码。
验证并优化刀具路径
检查生成的NC代码，确保其正确无误，并进行必要的优化。
传输NC代码至机床
将验证后的NC代码传输到数控机床，以便进行实际的加工操作。
在使用G99指令时，通常需要在程序中添加相应的G代码，并设置参数来控制刀具的速度。例如，可以使用G99 Pxxx来设置进给速度，其中xxx为具体的数值。另外，还可以使用G99 Fxxx来设置切削速度，其中xxx为具体的数值。
此外，如果在钻孔循环中需要自动输出G98和G99，可以在后处理构造器中进行设置，例如加入G99-Cycle Retract（AUTO/MANUAL）参数，以便在退刀类型改变时自动切换G98和G99。
请注意，G99指令的具体用法可能会因不同的数控系统而有所不同，因此在编写数控程序时，应该参考数控机床的操作手册或相关文档，了解具体的G99指令用法和参数设置。