爱奇艺和PPS的关系是 合并后的关系。具体来说，百度在2013年5月宣布以3.7亿美元现金收购PPS视频业务，并将其与百度旗下的视频网站爱奇艺合并。合并后的爱奇艺在财务、法律、人事层面实现了统一管理。爱奇艺高级营销副总裁王湘君升任首席营销官（CMO），全面负责爱奇艺和PPS品牌管理、广告销售工作。合并的主要目的是为了发挥两家公司在业务上的互补性，并保持两个品牌各自的优势特点和团队的灵活性。
合并后，爱奇艺和PPS在功能和资源上进行了整合，用户可以在一个平台上享受到两家公司的视频资源。不过，爱奇艺的视频资源相对更全一些，而PPS在P2P加载技术方面打开视频较快。此外，爱奇艺和PPS在品牌整合方面也保持了一定的灵活性，针对不同的广告客户，两个品牌仍将提供具有各自品牌特质的差异化解决方案。
综上所述，爱奇艺和PPS在合并后形成了紧密的关系，共同构成了中国最大的网络视频平台之一。