店铺转让费的存在主要是由于以下几个原因：
店铺装修及设备投入：
原店主在经营过程中可能对店铺进行了大量的装修和购置了特定的设备，这些投入增加了店铺的价值。新店主接手后需要承担这些已有的投入成本，因此会支付转让费。
客户资源积累：
原店主在长期经营中积累了一定的客户资源和商业信誉，这些无形的资产对于新店主来说具有一定的价值。新店主愿意支付转让费来获取这些客户资源，以便快速开展业务。
地段和位置：
店铺所在的地段和位置也会影响转让费的高低。位于繁华地段、人流量大的店铺，其商业价值较高，转让费也就相应较高。
租约年限和剩余租期：
店铺的租赁合同期限和剩余租期也会影响转让费。如果店铺的租赁合同剩余期限较长，且租金较为优惠，转让方可能会收取更高的转让费。
品牌价值和知名度：
如果店铺是某个知名品牌的加盟店，或者已经积累了稳定的客户群体，品牌价值也会提高转让费。具有独特品牌或经营模式的店铺，其转让费可能会因为市场稀缺性而增加。
商业惯例：
由于商铺转让费已经成惯例，因此市场上便出现了一些专门从事此类商铺经营的人，不包含任何项目，只是为了获取高昂的转租费而转让商铺。
市场供需关系：
在一些热门地段或热门行业，店铺的需求大于供给，转让者往往可以收取较高的转让费；而在一些冷清地段或冷门行业，转让费可能相对较低。
原经营者的主观定价：
转让费的高低也受到原经营者主观定价的影响，有时候原经营者会利用市场稀缺性或自己的经营经验来制定较高的转让费。
综上所述，店铺转让费的收取是多种因素综合作用的结果，它反映了店铺的不同价值和潜在收益。对于新店主来说，支付转让费可以让他们直接接手一个已经具备一定商业基础的商铺，从而节省了从零开始的时间和成本。然而，转让费过高可能会阻碍新租户的进入，影响商铺的流动性，因此政府和相关监管机构需要对转让费的收取进行规范，确保其合理性和市场公平性。