碧玉上的黑点主要是由 铁元素和铬元素聚集形成的。这些元素在碧玉的结晶过程中没有均匀分散，而是形成了可见的黑点或黑斑。具体来说，碧玉的主要矿物是透闪石和阳起石，而致色元素为三价铬离子和二价铁离子。当这些离子的含量适当且均匀时，碧玉会呈现出亮绿色或浅绿色。然而，当这些离子的含量过于浓缩时，就会形成黑点。
黑点的形成与碧玉的产地、矿口以及形成条件密切相关。不同产地的碧玉，其黑点的数量、分布和大小都有所不同。例如，俄罗斯碧玉、玛纳斯碧玉和加拿大碧玉等，尽管质地细腻温润，但通常都会有一些黑点。这些黑点不仅是碧玉的典型特征，也是鉴定碧玉的一个重要标志。
值得注意的是，黑点并不会影响碧玉的美观和价值。实际上，有黑点的碧玉在颜色上可能更加鲜艳，这种现象被称为“绿随黑走”。此外，黑点也是碧玉天然属性的体现，没有黑点的碧玉反而较为稀少且价格较高。
因此，碧玉上的黑点是天然形成的矿物成分，是碧玉特征的一部分，不应被视为品质低劣或假货的象征。在购买和欣赏碧玉时，了解黑点的形成原因和特征，有助于更全面地认识和评价碧玉的价值。