卡卡西杀琳的原因主要是 为了保护村子和小队成员的安全。在《火影忍者》中，琳是木叶村的亲兵之一，对村子的秘密和机密了解较多。如果她被敌方控制，可能会暴露出村庄的重要机密，从而严重威胁到木叶村的安全。同时，卡卡西也考虑到，如果琳成为了敌方，他们的小队成员也可能会遭到攻击。因此，为了确保小队成员的安全，卡卡西决定采取行动，杀死琳。
此外，卡卡西杀琳的行动也是出于对斑的阴谋的应对。斑为了控制带土，利用了琳作为诱饵，试图让卡卡西和带土自相残杀。琳在保护木叶的过程中，被雾忍追击，最终选择主动冲向卡卡西的雷切，以避免被敌人俘虏并泄露情报。
综上所述，卡卡西杀琳的行为是基于保护村子和小队成员安全的考虑，同时也是为了应对斑的阴谋。尽管这一行为在故事中引发了深刻的情感冲突和争议，但从剧情的发展来看，这是卡卡西在极端情况下做出的艰难选择。