科鲁兹B101E-48的编程步骤如下：
使用特定软件
需要使用特定的软件进行编程，例如中国通用软件。
选择车辆信息
在软件中选择相应的车辆信息，包括车辆选装件或其他相关信息。
处理故障码
如果设置了故障码，需要先对控制模块进行编程。如果再次设置该故障码，则可能需要更换控制模块。
在线编程
使用GDS+MDI在线进行车身控制模块（BCM）重新编程，故障码消失后故障排除。
确认VIN码
在编程过程中，需要确认车辆的VIN码，并正确选择【是】或【否】，手动输入17位正确的VIN码后选择【确定】。
选择操作软件
选择合适的操作软件进行编程，例如发动机校准。
防盗钥匙匹配
编程完成后，需要关闭点火开关30秒，并进行防盗钥匙匹配，选择更换ECM后的IMMO学习（匹配钥匙）。
读取VIN码
根据提示读取VIN码，并确认VIN码的正确性。
选择默认配置
选择【默认配置】，然后按照提示进行下一步操作。
确认配置成功
显示ECU配置成功后，选择【确定】完成编程过程。
建议：
在进行编程之前，请确保车辆处于安全状态，避免在编程过程中发生意外。
如果对编程过程不熟悉，建议寻求专业技术人员的帮助，以确保编程过程正确无误。