要在R中读取GEMTC文件,你需要遵循以下步骤:
安装gemtc包
打开RStudio。
在console中输入以下命令来安装gemtc包:
```R
install.packages("gemtc")
```
安装完成后,加载gemtc包:
```R
library(gemtc)
```
准备数据
将你的数据准备成GEMTC分析所需的格式。每一行代表一个研究,每一列代表不同的变量(如study, treatment, mean, std.dev, sampleSize等)。
例如,你可以使用read.csv()函数来读取CSV文件,并指定分隔符和标题行:
```R
data <- read.csv("your_data_file.csv", sep=",", header=TRUE)
```
创建网络数据结构
使用mtc.network()函数将数据转换成GEMTC网络格式:
```R
network <- mtc.network(data.re=data)
```
绘制网络图
使用plot()函数绘制网络图:
```R
plot(network)
```
建立和运行模型
使用mtc.model()函数建立模型,并指定模型类型(如consistency)、链数(n.chain)和似然函数(likelihood):
```R
model <- mtc.model(network, type = "consistency", n.chain = 3, likelihood = 'normal')
```
使用mtc.run()函数运行模型,并指定采样器(sampler)和适应次数(n.adapt):
```R
results <- mtc.run(model, sampler = "rjags", n.adapt = 5000)
```
这些步骤将帮助你在R中读取GEMTC文件,并进行网状meta分析。请确保你的数据文件格式正确,并且所有必要的变量都已包含在内。