在系统里写入软件通常有以下几种方法：
自定义安装路径
在安装软件时选择自定义安装路径，将安装路径改到非系统盘符下。这样可以避免修改系统盘，但这种方法并不能将软件真正“写入”系统，只是改变了安装位置。
静默安装
学习相应软件的静默安装参数，并编写批处理文件来实现静默安装。这种方法适用于已经封装好的系统，通过在Ghost浏览器中注入封装好的系统来实现软件的安装。
使用U盘PE
在U盘系统中加入软件，可以使用U盘PE中的加载外置启动程序的应用来实现。在所装系统中加上想要的软件，需要使用批处理文件来实现软件的静默安装，并在系统启动时自动运行这些批处理文件。
制作系统映像
可以通过制作系统映像文件，将软件直接写入系统镜像中。这种方法比较复杂，需要将软件及其依赖项都包含在镜像文件中，并进行适当的封装。
绿色版软件
使用绿色版软件，这种软件通常以压缩包形式出现，使用时先解压到硬盘的某个文件夹中，然后直接运行软件的执行文件即可。这种方法不需要修改系统文件，但需要确保软件的执行文件路径正确。
建议
对于普通用户：如果只是想在现有系统中安装软件，建议使用自定义安装路径或绿色版软件，这样可以避免复杂的操作。
对于高级用户：如果需要在多个系统或设备上快速部署软件，可以考虑使用静默安装或U盘PE的方法，这样可以提高效率。
对于系统开发者：如果需要将软件深度集成到系统中，可以考虑制作系统映像，但这需要较高的技术水平和更多的时间。
根据你的具体需求选择合适的方法，可以有效地将软件写入系统。