物流专用软件做账的方法主要依赖于软件的自动化流程和提供的财务管理功能。以下是一些关键步骤和功能：
应收运费结算：
当收到委托单位的运费时，在软件中进行登记。系统会自动将未结算的账务带到列表中，便于管理和跟踪。
应付运费结算：
在支付给承运车队（外包车队）运费时进行登记。操作原理与应收运费结算类似。
应付配件采购结算：
付款给采购配件时进行登记。系统会自动将未结算的账务带到列表中。
应付加油结算：
付款给定点加油站时进行登记。系统会自动将未结算的账务带到列表中。
应付维修结算：
付款给定点修理厂时进行登记。系统会自动将未结算的账务带到列表中。
收入核算流程：
包括收入确认、收入登记、收入核对等步骤。根据合同、运输单据和客户签收确认收入金额和时间，并在会计系统中登记收入，生成收入记录。
成本核算流程：
将成本分为运输成本、仓储成本、人力资源成本等，确定各项成本的计量方法，区分直接成本和间接成本，并进行合理分配。
费用核算流程：
根据票据和合同确认费用发生时间和金额，在会计系统中登记费用，并生成费用记录。
资产负债核算流程：
定期盘点和确认公司资产，如货车、仓库、设备等，并反映在资产负债表中。根据实际情况确认和登记负债，如应付账款、短期借款等，并反映在资产负债表中。
会计账务处理流程：
包括审核原始凭证、登记明细账、月末处理、结账对账、编制报表等步骤。
报表分析：
通过软件提供的报表分析功能，对公司的盈亏情况进行全面分析和评估，寻找优化空间。
多账簿管理：
对于有多个子公司或不同财务制度的物流公司，软件提供多账簿管理解决方案，帮助统一管理不同地区、不同财务制度的财务数据。
单据管理：
软件提供单据管理解决方案，帮助物流公司实现进出货物单据的图片化管理、归档和利用，方便查找。
自动记账和报表生成：
一些高级的物流专用软件还提供自动记账功能，能够自动从银行获取对公户的变动情况，生成对应的记账凭证，并自动记入财务报表。此外，软件还能自动处理发票和工资单，生成规范的记账凭证和财务报表。
在选择物流专用软件时，建议考虑软件的功能全面性、易用性、数据准确性和安全性等方面，以确保能够高效、准确地完成账务处理工作。同时，与各个部门的沟通和协调也是确保账务处理顺利进行的关键。