在销售医疗器械并赠送软件时，开票方式应基于软件的性质和购买方需求来确定。以下是具体的开票步骤和建议：
分别开具发票
医疗器械部分：按正常销售开具增值税普通发票。
软件部分：若为软件服务费，需单独开具发票，并按照软件服务的税率（如6%）来开具。
视同销售处理
赠送的软件部分需视同销售处理，即使不单独开具发票，也需计算并缴纳相应的增值税。
发票内容
发票内容应分别注明医疗器械和软件的名称、数量、单价等信息。
发票上需注明“赠送”字样，并明确赠送产品的税额为0。
税率和税额
医疗器械部分按照医疗器械的税率（如16%）开具发票。
软件部分按照软件服务的税率（如6%）开具发票。
发票交付
将开具好的发票分别交付给购买方和赠送方。
建议
咨询当地税务部门：由于税收政策和规定可能会有所变动，建议在实际操作前咨询当地税务部门，确保开票方式符合最新的税收法规。
保持记录：确保所有开票信息准确无误，并妥善保存发票，以备日后报销或备案之需。
通过以上步骤和建议，可以确保在销售医疗器械并赠送软件时，开票过程既合规又准确。