收到软件法务函后，企业应采取以下步骤进行回复：
自查
确认使用情况：首先，企业应进行自查，确认是否有员工安装或使用相关软件，以及这些软件是否用于企业生产经营。
收集证据：根据自查结果，企业应收集相关证据，如员工使用软件的情况、是否用于商业目的等。
制定应对方案
无侵权情况：如果企业员工并未安装或使用相关软件，或安装使用但未用于企业生产经营，企业可以不予理睬，或要求对方提供侵权证据，无法提供则可能不再纠缠。
有侵权情况：如果企业员工安装使用相关软件且用于企业生产经营，企业应保持沉默，寻求专业律师帮助。
回复法务函
明确回复：在回复法务函时，企业应明确说明情况，如员工个人使用、未用于企业生产经营等，并提供相应证据。
保持冷静：企业应保持冷静，不要过于紧张或采取“鸵鸟政策”，应积极寻求解决办法，维护企业合法权益。
寻求专业帮助
咨询律师：在必要时，企业应咨询专业律师，获取法律建议和支持。
正版化手段：企业可以考虑购买正版软件，以合法使用软件并避免法律风险。
记录和归档
记录沟通情况：企业应记录与法务函相关的所有沟通和回复，以备后续可能的法律程序。
归档文件：将相关文件和证据归档，以便日后查阅。
建议
及时回应：企业应尽快回复法务函，避免延误导致法律风险增加。
保持透明：在回复中应保持透明，如实说明情况，避免隐瞒或误导。
预防为主：企业应加强内部管理，防止类似情况再次发生，如定期检查员工软件使用情况，培训员工遵守知识产权法律法规。
通过以上步骤，企业可以有效地应对软件法务函，维护自身的合法权益。