《西游记》在明朝被列为禁书的原因主要有以下几点：
影射皇室
书中人物如猪八戒，其原型可能被解读为明朝开国皇帝朱元璋。猪八戒的形象和经历被认为是对朱元璋的影射和挖苦，这对皇室来说是一种冒犯。
宗教倾向问题
《西游记》主要宣扬佛教思想，如唐僧师徒四人西天取经、观世音菩萨的救赎等，这与当时明朝皇帝嘉靖所推崇的道教相冲突。嘉靖皇帝痴迷道教，甚至为了修炼道法而荒废朝政。
思想叛逆问题
书中孙悟空的反抗精神，如大闹天宫和“皇帝轮流做，明年到我家”的言论，被视为对封建皇权的挑战和威胁。这种角色和言论在封建时代被认为是大不敬，会腐蚀百姓的思想，对统治者的权威构成威胁。
名字的“误会”
《西游记》中的“西游”二字，虽然看似与明朝国姓“朱”无关，但“猪八戒”的“猪”字与“朱”字同音，这在当时被认为是对皇帝的不敬。
对道教的批评
书中不仅描写了车迟国皇帝推崇道教、迷信成仙的情节，还通过孙悟空大闹天宫等情节讽刺了道士的无能，这被一些人视为对道教和嘉靖皇帝的影射讽刺。
综上所述，《西游记》因其在宗教、政治和思想上的敏感性，被明朝统治者视为禁书。这些原因不仅反映了当时社会的政治和文化环境，也揭示了文学作品在历史背景下的复杂影响。