超梦和梦幻之间的关系是 克隆体与本体的关系。超梦是由梦幻的遗传因子通过基因工程实验克隆出来的宝可梦。它具有梦幻一样强大的力量，但性格和体型却与梦幻截然不同。超梦不仅在力量上远超梦幻，还拥有两种mega进化形态，实力上能与mega裂空座并列第一。
在剧场版中，梦幻和超梦的实力表现不相上下，主要原因是梦幻的等级远高于刚出生的超梦。此外，超梦是由科学家在历经多年的基因结合及DNA工程实验后从梦幻身上克隆出来的，因此它们之间存在明显的基因联系。
综合以上信息，可以得出结论：超梦是梦幻的克隆体，它们之间具有紧密的基因联系，但在性格和某些能力上存在显著差异。