种曲，也称为曲种，是 用于制作大曲的种菌。大曲是一种用于酿造酱油的微生物发酵剂，由米曲霉等微生物经过纯培养后产生大量孢子，再接种到制曲原料上，以得到大量良好的曲子。种曲的质量直接影响酱油曲的质量、成熟速度和成品质量。
具体来说，种曲是米曲霉，属于半知菌亚门、丝孢纲、丝孢目、从梗孢科、曲霉属真菌中的一个常见种。通过将曲菌进行纯培养，产生大量繁殖力强的孢子，然后将这些孢子接种到制曲原料上，可以使曲霉充分繁殖，从而得到高质量的曲子。
因此，种曲在酱油生产过程中起着至关重要的作用，是确保酱油品质的关键因素之一。