关于兔子的祖先，科学家们提出了几种不同的理论，但目前的证据支持以下几种观点：
钉齿兽（Gomphos elkema）
钉齿兽是一种生活在约1亿3000万年前的真兽类哺乳动物，体长约14公分，体重在200到250克之间。其牙齿特征与兔子相似，被认为是兔子的祖先之一。
攀援始祖兽（Scansoria）
攀援始祖兽也是一种生活在约1亿3000万年前的真兽类哺乳动物，体长约14公分，体重在200到250克之间。其肢骨特征表明它可能具有灵活攀援的能力，也被认为是兔子的祖先之一。
穴兔（Oryctolagus cuniculus）
穴兔是家兔的祖先，体长为38-50厘米，尾长4-7厘米，体重1300-3000克。穴兔善于挖穴，主要在黎明活动，是兔科动物的代表，也是所有家兔的祖先。
模鼠兔（Mimotona）
模鼠兔生活在安徽潜山古新世，被认为是兔形目与啮齿目的共同祖先。模鼠兔的发现表明，兔形目动物在演化过程中与啮齿目动物分道扬镳。
综合以上信息，虽然钉齿兽、攀援始祖兽和穴兔都被认为是兔子的祖先，但目前最广泛接受的观点是穴兔作为家兔的直接祖先。模鼠兔作为兔形目与啮齿目的共同祖先，则代表了更早期的演化阶段。