孔子姓孔的原因主要与他的家族背景和氏的使用有关。以下是详细解释：
孔氏的来源
孔子的氏“孔”来源于他的祖父孔父嘉的字“孔父”。在古文献中，孔父嘉被称为孔氏，因此孔子的后代以孔为氏。
孔子的先祖本是宋国公室成员，传到孔父嘉时，五世亲尽，别为公族，故后以孔为氏焉。
姓氏合流
在古代，姓和氏是分开的，但到了孔子及其后人，姓氏逐渐合流，孔子后人以孔为姓氏。
孔子本人名丘，字仲尼，后来姓氏合一，所以按照后人的习惯，说孔子姓孔也没啥毛病。
家族背景
孔子的祖先是殷商王族的后裔，追根溯源，殷商王族的姓是“子”。因此，孔子从血缘根基上讲，姓“子”。
孔子的家族在周灭商后，逃到了鲁国，逐渐在鲁国开枝散叶，就以“孔”作为家族的氏延续下来。
综上所述，孔子姓孔的原因主要是他的氏“孔”来源于祖父孔父嘉的字，后来姓氏合一，以及他的家族背景和祖先的血缘关系。