三菱系统的顶程序编程可以通过以下步骤进行：
使用GX Works3进行编程
三菱系统使用GX Works3作为编程工具，这是一款集中管理三菱PLC、HMI和调试软件的集成开发环境。工程师可以在GX Works3中进行全面的编程和调试，提高开发效率。
直接在机床主面板上手动编程
可以通过机床主面板上的手动编程功能进行顶程序编程。具体步骤如下：
进入主菜单。
选择编辑键。
按下功能键。
选择新建（打开）以在右边进行手动编辑程序。
在电脑上编好程序后上传到系统加工中心
可以在电脑上使用GX Works3或其他编程软件编好程序，然后上传到系统加工中心（CNC）。加工中心具备自动换刀功能，可以对工件一次装夹后进行多工序加工。
建议：
初学者：建议先使用GX Works3进行编程，因为这是一个功能强大的集成开发环境，可以帮助初学者快速上手并掌握编程技巧。
熟练工程师：对于熟练的工程师来说，可以直接在机床主面板上进行手动编程，以提高编程效率。同时，也可以结合使用电脑上的编程软件进行程序的编写和调试。
希望这些信息对你有所帮助。