在Linux系统中找不到编程指令可能有以下几种原因：
Java路径不在系统路径中
如果您在安装Java时没有将其添加到系统路径中，那么运行Java指令时就会找不到。在这种情况下，您需要在命令行中手动指定Java的完整路径，或将其添加到系统路径中。例如：
```sh
/usr/java/jdk1.8.0_121/bin/java -version
```
或者，您可以将Java路径添加到`~/.bashrc`或`~/.bash_profile`文件中，以便每次登录时自动设置：
```sh
export PATH=$PATH:/usr/java/jdk1.8.0_121/bin
```
指令输入错误
请确保您输入的Java指令正确；如果输入有误，Linux将无法找到该指令。请参阅Java文档，以确保您正确地输入Java指令和选项。
Java未正确安装或已损坏
如果Java未正确安装或已损坏，那么Linux就无法找到Java指令。请检查您的Java安装是否完整和正确，并检查Java文件是否存在于系统中。
操作系统没有权限访问Java
如果Linux没有正确的权限来读取和执行Java文件，那么它将无法找到Java指令。请确保您有足够的权限来访问Java文件，并将文件权限设置为可读和可执行。
命令未安装
如果您尝试运行的命令在Linux系统中没有安装，系统会提示“command not found”或类似的错误信息。这说明你需要先安装该命令才能使用。您可以使用包管理器安装命令，例如在Ubuntu上使用`apt`，在CentOS上使用`yum`。
命令不在系统PATH中
PATH是一个环境变量，用于指定系统在哪些目录中查找命令。如果命令不在PATH指定的目录中，系统就找不到该命令。您可以通过以下方法解决该问题：
手动添加命令所在的目录到PATH中：
```sh
export PATH=$PATH:/command_directory
```
将命令移动到已经在PATH中的目录中：
```sh
sudo mv /path/to/command /usr/local/bin/
```
命令名称拼写错误
在输入命令时，可能会出现拼写错误，导致系统找不到该命令。请仔细检查命令的拼写，并使用Tab键进行自动补全来避免拼写错误。
权限问题
有些命令可能需要root权限才能执行，如果您没有足够的权限，系统会提示“permission denied”。您可以尝试使用`sudo`命令来以管理员身份执行命令，或者联系系统管理员授权您执行该命令。
软件包未安装或未配置
有些命令可能需要特定的软件包才能正常运行。您可以尝试使用包管理器来安装缺失的软件包。另外，某些命令可能需要配置文件或环境变量才能使用，您可以查阅命令的官方文档来获取更多信息。
通过以上方法，您应该能够找到并解决Linux系统中找不到编程指令的问题。