1998年的洪水主要发生在 长江、嫩江、松花江流域。这场洪水是继1931年和1954年两次洪水后，20世纪发生的又一次全流域型的特大洪水之一。其中，长江洪水尤为严重，是继1954年以来的又一次全流域性大洪水。此外，嫩江和松花江的洪水也是150年来最严重的全流域特大洪水。
具体受灾情况如下：
长江：洪水量级大，洪峰水位高，持续时间之长均为历史罕见。长江大通水文站最大洪峰流量达82300米³/秒，仅次于1954年，为有历史记录以来第二大洪水。
嫩江：嫩江流域发生超过历史记录的特大洪水，嫩江大赉水文站最大洪峰流量达16100米³/秒。
松花江：松花江哈尔滨水文站最大洪峰流量达16600米³/秒，均为历史之最。
受灾最严重的省份包括江西、湖南、湖北和黑龙江，全国共有29个省（区、市）遭受了不同程度的洪涝灾害。受灾面积达3.18亿亩，成灾面积1.96亿亩，受灾人口2.23亿人，死亡4150人，倒塌房屋685万间，直接经济损失达1660亿元人民币。