许仙这一角色之所以由女演员出演，主要是基于以下几个原因：
角色设定：
许仙在剧情中被设定为一个文文弱弱的书生，性格懦弱且偏向女性化。这种设定使得女性演员在扮演时能更自然地表现出许仙的细腻情感和性格特点，而男演员可能难以完全诠释这种女性化的气质。
演员选择：
叶童在之前的影视作品中有过成功的女扮男装表演经验，例如在《碧海情天》中的表现给剧组留下了深刻印象。她的演技和气质非常适合许仙这一角色，能够将角色的内心世界和情感表现得淋漓尽致。
避免尴尬：
在拍摄过程中，许仙与白蛇有很多亲密戏。如果由男演员出演，可能会引发一些尴尬或负面报道。而女性演员在拍摄这些戏份时更加自然，能够避免这些不必要的麻烦。
时代背景：
当时的社会观念相对保守，即使是演员也不愿意与陌生男子有过多接触。选择女性演员出演许仙，可以在一定程度上减少这种尴尬，同时也能给观众带来新的看点。
剧组创新：
剧组在选角时大胆尝试，认为由女性出演许仙是一种创新的尝试，能够给观众带来不一样的感受。这种尝试最终取得了成功，叶童的表演赢得了观众的广泛认可。
综上所述，许仙由女演员出演，主要是基于角色设定、演员选择、避免尴尬、时代背景以及剧组创新等多方面的考虑。这一选择不仅成功塑造了许仙这一角色，也为《新白娘子传奇》增添了独特的魅力。