软件申请专利的流程大致可以分为以下几个步骤：
准备申请材料
软件著作权申请：需要准备著作权申请表、软件设计说明书、源代码、申请书、营业执照副本、承诺书等文件。
软件测试：准备测试评价委托申请表、用户手册、软件设计说明书、软件安装程序（如光盘）等，并提交给计算机软件测评重点实验室进行测试。
软件产品登记：在网上填写申请书，并附上营业执照副本、组织机构代码证、软件测试报告、著作权证等，提交给当地软件产品登记机构审核。
提交专利申请
发明专利：需要提交请求书、说明书及其摘要、权利要求书、说明书附图等文件。发明专利申请涉及计算机程序的，需要将计算机程序与计算机硬件作为一个整体来考虑。
实用新型或外观设计专利：需要提交请求书、说明书及其摘要、权利要求书、外观设计图片或者照片等文件。
专利审查
受理与初审：专利局受理处或代办处收到申请后，确定申请日，给予申请号，发出受理通知书。
公布与实质审查：发明专利申请经过初审后，会进入公布阶段，随后进行实质审查。实用新型或外观设计专利则直接进行初步审查。
授权与公告
授权通知：通过实质审查的专利申请将被授权，专利局会发出授权通知书。
公告：授权后的专利会进行公告，并颁发专利证书。
维护与维权
年费缴纳：专利授权后，需要定期缴纳年费以维持专利的有效性。
维权：如发现他人侵犯专利权，可以通过法律途径进行维权。
建议在申请软件专利时，考虑委托专业的专利代理机构，以确保申请文件的质量和申请流程的顺利进行。同时，确保软件的创新性和独特性，以便在专利申请和后续的维权中获得更大的保护。