定制软件的付款方式通常采用分阶段付款模式，具体的付款比例和方式可以根据双方协商确定。以下是一些常见的付款方式：
预付合同款项40%
在签订合同时，客户需要预付软件项目开发总价的40%作为预付款。付款后，软件开发公司开始制定项目开发计划。
软件开发需求确定后支付30%的款项
在软件开发前，需要与客户进行深度沟通，采集相关需求。由项目经理和产品经理梳理需求，并确定功能模块。设计产品原型后，与客户确认需求。确认无误后，支付需求确认款项。
软件产品交付支付20%的款项
软件编写和测试完毕后，确保软件可以正常运行，并给客户展示运行效果。得到客户认可后，软件公司会将源码程序和相关技术文件交给客户。双方验收完毕后，支付产品交付款项。
352付款方式
一种常见的付款方式是352，即签订合同预付30%开始开发，开发过程中支付50%左右，软件交付并通过验收后支付剩余的20%左右。
逐次付款
合同会规定逐次付款，例如软件开发前预付20%，需求确认后付30%，程序开发完成后付40%等。合同还会预留10%-20%的尾款，在软件正式运行2个月内付清。
后期维护费用
有些合同会规定后期维护费用按实际发生情况另行结算，这通常在软件交付并通过验收后进行。
建议
选择合适的付款方式时，应综合考虑项目的风险、资金流和双方的信任度。分阶段付款模式可以更好地保障交易双方的利益，但具体比例和方式应根据实际情况进行协商和明确。建议在签订合同前，详细讨论并确定付款细节，以避免后期纠纷。