软件版权保护的鉴定是一个复杂的过程，涉及多个方面的考量。以下是鉴定软件版权保护的主要方法：
对比代码
将被怀疑侵权的软件代码与享有著作权的软件代码进行逐行对比，查看是否存在实质性相似的部分。相似的程度以及相似代码在整个软件中的比重等都是重要考量因素。
功能与结构对比
除了代码，还需对比软件的功能和结构。如果两者的主要功能相似，且整体结构框架相近，也可能构成侵权。
接触与相似性分析
判断侵权方是否有接触到享有著作权软件的机会。如果侵权方有接触可能，且软件之间存在相似性，那么侵权的可能性就较大。
其他证据
参考其他证据如侵权行为表现（如未经授权进行复制、销售等），以及相关的合同、通信记录等，也可以作为判断侵权的依据。
实质性相似加接触分析法
这种方法要求对原被告双方的软件进行分析，一般可按照先文字成份，后非文字成份的顺序进行。如果两个软件相似，且再认定被告接触过原告软件的行为成立，则侵权即可认定。
抽象、过滤、比较分析法
这种方法通过抽象过滤和比较三个步骤相结合，判断被告软件中的结构顺序以及组织是否侵犯了原作的著作权。
版权登记信息查询
通过中国版权保护中心网站查询软件著作权的基本信息，如登记状态、登记日期等，以初步判断其真伪。
实地查询
实地前往当地版权行政管理部门或相关机构，提供要查询的软件著作权信息，通过内部系统进行核实和查询。
委托专业知识产权服务机构
委托专业的知识产权服务机构进行查询，这些机构具备专业的查询渠道和经验，能提供详细的查询报告和意见。
法院认定
最终的侵权认定需要法院根据上述方法进行综合判断，并可能需要进行司法程序，包括提供证据、质证等。
建议
在进行软件版权保护鉴定时，建议采取以下步骤：
收集证据：
收集所有可能相关的证据，包括软件代码、功能描述、结构框架、使用记录等。
选择合适的鉴定方法：
根据具体情况选择实质性相似加接触分析法或抽象、过滤、比较分析法等。
专业咨询：
考虑委托专业的知识产权服务机构进行咨询和鉴定，以确保结果的准确性和公正性。
法律途径：
如果存在争议，建议通过法律途径解决，包括向版权行政管理部门投诉或向法院提起诉讼。
通过上述方法，可以较为准确地鉴定软件著作权是否受到侵犯，并采取相应的法律措施保护自己的权益。