要证明软件是自主研发，可以采取以下措施：
保留开发过程记录
从项目启动之初，保留所有与开发过程相关的记录，包括需求分析文档、设计文档、代码版本控制记录（如Git提交历史）、开发日志、测试报告等。这些记录能够清晰地展示软件从构思到实现的全过程，证明开发者在没有任何外部源代码或设计基础上，独立完成了软件的创作。
申请软件著作权
向国家版权局提交软件著作权登记申请，并成功获得登记证书。软件著作权登记证书不仅是对软件独立开发的有力证明，还能在发生版权纠纷时提供有效的法律支持。
公开透明展示技术细节
在适当的场合和平台上，公开透明地展示软件的技术细节和实现过程，例如在开源社区发布软件的源代码，通过技术论坛、博客等方式分享开发过程中的经验、挑战及解决方案。这种公开透明的态度能够增强公众对软件独立开发性的信任，还能促进技术交流与合作。
邀请第三方机构进行鉴定
对于复杂或高价值的软件项目，可以邀请具有公信力的第三方机构进行技术鉴定。这些机构通常具备专业的技术能力和丰富的行业经验，能够通过对软件源代码、设计文档、开发过程记录等进行全面审查，出具客观、公正的鉴定报告。
保留完整的软件开发过程记录
在软件开发过程中，务必保留完整的开发记录，包括需求分析、设计文档、源代码、测试报告等。这些文件可以作为您是软件创作者的有力证据。同时，确保这些文件的创建时间与实际开发时间相符，以免引起不必要的怀疑。
编写详细的设计文档
设计文档是软件开发过程中的重要文件，它详细描述了软件的功能、结构和实现方法。在编写设计文档时，务必注明自己是软件的开发者，并在文档中留下您的联系方式。这样，在申请软件著作权时，您可以用设计文档证明自己是软件的创作者。
在源代码中添加版权声明
在源代码中添加版权声明，明确标注自己的身份信息，这可以作为软件原创性的初步证明。
通过上述措施，可以有效地证明软件的自主研发性，确保创作者的权益得到保护。