软件行业申请高新技术企业的流程如下：
自我评价与准备材料
企业首先进行自我评价，判断是否符合高新技术企业的认定条件。
准备必要的申报材料，包括企业注册信息、知识产权证明、研发项目立项证明、科技成果转化材料、科技人员情况说明、财务审计报告等。
网上注册登记
登录“高新技术企业认定管理工作网”进行注册登记，填写《企业注册登记表》。
完善企业基本信息，保存并打印《企业基本信息完善表》，然后选择所在地的认证机构提交。
提交认定申请
在地方认定机构初步审核企业资料后，激活企业账号。
登录平台填写并提交《高新技术企业认定申请书》，并按要求添加专利、各种报告等附件，完成校验后提交。
专家评审
认定机构组织至少5名评审专家组成专家组，对申报材料进行内容审查。
专家根据评审标准打分评定，并提出评审意见。
审查认定
认定机构结合专家组的评审意见，对申请企业进行综合评审或实地核查。
拟定认定企业名单，报国家评审机构备案，并进行公示。
公示与颁发证书
公示无异议的企业，将获得高新技术企业认定，并由认定机构颁发统一印制的《高新技术企业证书》。
后续支持
认定后，企业可以享受税收优惠和财政拨款等政策支持。
建议
组织专业团队：组建由科技、财务、法务等部门组成的专业申报团队，确保材料的真实性和完整性。
关注政策动态：及时关注高新技术企业的最新政策和申报指南，确保申报材料符合最新要求。
强化财务管理：规范企业的财务管理和会计核算，确保财务数据的真实性和准确性。
重视知识产权：积极申请和维护相关知识产权，以增强企业的核心竞争力。
通过以上步骤，软件企业可以顺利完成高新技术企业的申报工作，享受相应的政策支持和市场优势。