r软件如何计算auc

时间:2025-02-28 05:52:12 电视电影

在R软件中,有多种方法可以用来计算AUC(Area Under the Curve)。以下是一些常用的R包及其使用方法:

survivalROC包

安装:`install.packages("survivalROC")`

加载:`library(survivalROC)`

计算AUC的置信区间:

```R

survivalROC::survivalROC(time, status, predictor, conf.int = TRUE)

```

其中,`time`是一个向量,表示每个观察者的生存时间;`status`是一个向量,表示每个观察者的生存状态(通常为0或1);`predictor`是一个向量,表示每个观察者的预测值。

pROC包

安装:`install.packages("pROC")`

加载:`library(pROC)`

计算AUC面积:

```R

true_labels <- sample(0:1, 100, replace = TRUE)

predicted_probs <- runif(100)

roc_obj <- roc(true_labels, predicted_probs)

auc_value <- auc(roc_obj)

```

这里,`true_labels`是真实的类标签,`predicted_probs`是模型预测的概率值。

ROCR包

安装:`install.packages("ROCR")`

加载:`library(ROCR)`

计算AUC:

```R

predictions <- c(0.8, 0.7, 0.6, 0.9, 0.5, 0.4, 0.3)

labels <- c(1, 1, 0, 1, 0, 0, 1)

pred_df <- data.frame(predictions, labels)

perf <- performance(pred_df, measures = "auc")

auc <- perf$auc

```

在这个例子中,`predictions`是模型预测的概率值,`labels`是真实标签,`pred_df`是一个数据框,包含预测值和标签。`performance`函数用于计算AUC。

h2o包

安装:`install.packages("h2o")`

加载:`library(h2o)`

计算AUC值:

```R

h2o.init()

pred_prob <- c(0.8, 0.7, 0.6, 0.9, 0.5, 0.4, 0.3)

pred_df <- as.h2o(data.frame(pred_prob))

perf <- h2o.performance(pred_df, "auc")

auc <- perf$auc

```

这里,`pred_prob`是模型预测的概率值,`pred_df`是一个数据框,包含预测值。`h2o.performance`函数用于计算AUC。

这些包都提供了方便的函数来计算AUC,你可以根据具体的需求选择合适的包进行使用。