申请软件著作权证的基本流程如下：
填写申请表
登录中国版权保护中心网站，注册账号并进行实名认证。
在网站上选择“计算机软件著作权登记申请”，在线填写申请表，内容涵盖软件名称、版本号、开发完成日期、发表状态、开发者信息等，并确认、提交打印。
准备申请材料
根据申请表的要求，准备相关申请材料，包括营业执照副本复印件、软件产品登记证书复印件、身份证复印件、软件设计说明书等。如果是委托代理机构办理的，还需要提交代理委托书。
提供软件作品样本，确保作品清晰可辨。
提供作者的有效身份证件（如身份证、护照等）以及联系方式。
根据具体情况，可能需要提供如软件开发合同、测试报告等额外证明材料。
提交申请
可以通过在线提交电子版材料，或现场提交并邮寄纸质材料至中国版权保护中心北京受理大厅，也可以选择邮寄方式。
审核过程
中国版权保护中心会对提交的申请材料进行严格审核。审核时间一般为20-30个工作日，期间可能会进行补充材料或者通知你补正。
如果材料不符合要求，会发出补正通知书，申请人需在规定期限内补正，逾期不补正的，申请将被视为撤回。
领取证书
如果软件著作权申请通过了审核，申请人可在中国版权保护中心领取软件著作权证书。拿到证书后，记得要及时备案，以便在后续的使用和维护过程中能够证明你对软件的合法权益。
缴费成功后，进入证书制作阶段。申请人可在规定时间内登录官网查询办理进度，制作完成后，可到中国版权保护中心领取证书，也可选择邮寄方式获取。
建议
提前规划：在填写申请表之前，要提前规划好软件的名称和版本号，确保名称和版本号的准确性。
充分准备：确保所有必要的材料都已经准备好，特别是身份证复印件和软件设计说明书等关键材料。
保持沟通：在整个申请过程中，保持与版权保护中心的沟通，及时关注审核进度并配合补正。
选择专业机构：如果对申请流程不太了解，或者觉得自己申请材料不够完善，可以选择专业的代理机构来协助办理，他们有着丰富的经验和专业知识，可以帮你更高效地完成申请。