吉首大学的王牌专业包括：
体育教育
软件工程
汉语言文学
物理学
旅游管理
武术与民族传统体育
化学
计算机科学与技术
法学
英语
音乐学
生物科学
工商管理
新闻学
舞蹈学
食品科学与工程
网络与新媒体
数学与应用数学
经济学
思想政治教育
小学教育
商务英语
历史学专业
机械设计制造及其自动化
电子信息工程
通信工程
土木工程
环境工程
城乡规划
临床医学
31. 针灸推拿学
32. 药学
33. 护理学
34. 会计学
35. 环境设计
36. 数字媒体艺术
这些专业在教学质量和研究实力方面均得到了广泛认可，并且多数专业入选了国家级一流本科专业建设点。建议学生在选择专业时，可以优先考虑这些王牌专业，以获得更好的教育资源和职业发展机会。